Raw Level automatisiert zertifiziert US beta

Diese Daten erreichen Raw Level am on 22 October 2015 das bedeutet dies ist ein großartiger Schritt für die Grundlagen der Veröffentlichung offener Daten.

ToxCast Phase I

Zusammenfassung

Art der Freigabe
a one-off release of a single dataset

Datenlizenz
Not Applicable

Inhaltslizenz
Creative Commons CCZero

Bestätigung
automatisiert zertifiziert

Veröffentlichungsdatum
22 April 2015
Änderungsdatum
22 October 2015
Aktualisierungshäufigkeit
asNeeded
Herausgeber
U.S. Environmental Protection Agency
Identifier
toxcast-phase-i
Landing Page
http://catalog.data.gov/dataset/toxcast-phase-i

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Beschreibung

Background: Chemical toxicity testing is being transformed by advances in biology and computer modeling, concerns over animal use and the thousands of environmental chemicals lacking toxicity data. EPA's ToxCast program aims to address these concerns by screening and prioritizing chemicals for potential human toxicity using in vitro assays and in silico approaches. Objectives: This project aims to evaluate the use of in vitro assays for understanding the types of molecular and pathway perturbations caused by environmental chemicals and to build initial prioritization models of in vivo toxicity. Methods: We tested 309 mostly pesticide active chemicals in 467 assays across 9 technologies, including high-throughput cell-free assays and cell-based assays in multiple human primary cells and cell lines, plus rat primary hepatocytes. Both individual and composite scores for effects on genes and pathways were analyzed. Results: Chemicals display a broad spectrum of activity at the molecular and pathway levels. Many expected interactions are seen, including endocrine and xenobiotic metabolism enzyme activity. Chemicals range in promiscuity across pathways, from no activity to affecting dozens of pathways. We find a statistically significant inverse association between the number of pathways perturbed by a chemical at low in vitro concentrations and the lowest in vivo dose at which a chemical causes toxicity. We also find associations between a small set in vitro assays and rodent liver lesion formation. Conclusions: This approach promises to provide meaningful data on the thousands of untested environmental chemicals, and to guide targeted testing of environmental contaminants.


Allgemeine Informationen

  • Die Beschreibung der Daten befindet sich unter

    http://catalog.data.gov/dataset/toxcast-phase-i Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Die Daten werden veröffentlicht von…

    U.S. Environmental Protection Agency Do you think this data is incorrect? Let us know


Rechtliche Information

Dieser Datensatz wurde durch die US Regierung erstellt, so dass die er gemeinfrei sein sollte. Allerdings erlaubt das US Urheberreciht den offenen Zugang nur für Staatsbürger der Vereinigten Staten, wir haben angenommen dass die Daten für den Rest der Welt statt dessen als CC0 lizenziert sind, das dies dem Geist der Open Data Richtlinie der US Regierung entspricht.
  • Die Nutzungsbestimmungen finden sich unter

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  • Under which licence can people outside the US reuse this data?

    Creative Commons CCZero Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Es gibt

    yes, and the rights are all held by the same person or organisation Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Die Inhalte können im Rahmen der folgenden Lizenz weiterverwendet werden

    Creative Commons CCZero Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Die Daten enthalten

    keine personenbezogenen Daten Do you think this data is incorrect? Let us know


Praktische Hinweise

  • Die Daten finden sich im Katalog…

    http://catalog.data.gov/organization/epa-gov Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Die Genauigkeit oder Bedeutsamkeit dieser Daten

    wird veralten, enthält aber Zeitstempel Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Die Daten werden

    örtlich getrennt gesichert Do you think this data is incorrect? Let us know


Technische Hinweise

  • Die Daten werden veröffentlicht unter

    http://epa.gov/ncct/toxcast/data.html Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Das Format der Daten ist

    ein standardisiertes offenes Format Do you think this data is incorrect? Let us know


Soziale Hinweise

  • Die Dokumentation enthält maschinenlesbare Daten für

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  • Einen Ansprechpartner zu diesen Daten finden Sie unter

    http://catalog.data.gov/dataset/toxcast-phase-i Do you think this data is incorrect? Let us know

  • Wie sie Verbesserungen dieser Daten vorschlagen können erfahren Sie unter

    http://www.data.gov/issue/?media_url=http://catalog.data.gov/dataset/toxcast-phase-i Do you think this data is incorrect? Let us know